SOX14 |
---|
|
Ідентифікатори |
---|
Символи | SOX14, SOX28, SRY-box 14, SRY-box transcription factor 14 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 604747 MGI: 98362 HomoloGene: 31224 GeneCards: SOX14 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • sequence-specific DNA binding • DNA binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • компонент клітини |
---|
Біологічний процес | • regulation of neuron migration • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • зір • entrainment of circadian clock • диференціація клітин |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (білок) | | |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 3: 137.76 – 137.77 Mb | Хр. 9: 99.76 – 99.76 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
SOX14 (англ. SRY-box 14) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 240 амінокислот, а молекулярна маса — 26 485[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSKPSDHIKR | | PMNAFMVWSR | | GQRRKMAQEN | | PKMHNSEISK | | RLGAEWKLLS |
EAEKRPYIDE | | AKRLRAQHMK | | EHPDYKYRPR | | RKPKNLLKKD | | RYVFPLPYLG |
DTDPLKAAGL | | PVGASDGLLS | | APEKARAFLP | | PASAPYSLLD | | PAQFSSSAIQ |
KMGEVPHTLA | | TGALPYASTL | | GYQNGAFGSL | | SCPSQHTHTH | | PSPTNPGYVV |
PCNCTAWSAS | | TLQPPVAYIL | | FPGMTKTGID | | PYSSAHATAM |
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Malas S., Duthie S., Deloukas P., Episkopou V. (1999). The isolation and high-resolution chromosomal mapping of human SOX14 and SOX21; two members of the SOX gene family related to SOX1, SOX2, and SOX3. Mamm. Genome. 10: 934—937. PMID 10441749 DOI:10.1007/s003359901118
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Cremazy F., Soullier S., Berta P., Jay P. (1998). Further complexity of the human SOX gene family revealed by the combined use of highly degenerate primers and nested PCR. FEBS Lett. 438: 311—314. PMID 9827568 DOI:10.1016/S0014-5793(98)01294-0
- Arsic N., Rajic T., Stanojcic S., Goodfellow P.N., Stevanovic M. (1998). Characterisation and mapping of the human SOX14 gene. Cytogenet. Cell Genet. 83: 139—146. PMID 9925951
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11193 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
- ↑ UniProt, O95416 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 30 серпня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| (1) Основні домени |
---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
| (1.4) NF-1 | |
---|
| (1.5) RF-X | |
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| | (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
| підродина 2 | |
---|
| підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
| підродина 4 | |
---|
| підродина 5 | |
---|
| підродина 6 | |
---|
| підродина 0 | |
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
| (2.6) WRKY | |
---|
|
| | (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
| (3.1) Гомеобокс | |
---|
| (3.2) Парний бокс | |
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| | (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
| (4.1) RHR | |
---|
| (4.2) STAT | |
---|
| (4.3) p53 | |
---|
| (4.4) MADS | |
---|
| (4.6) TATA | |
---|
| (4.7) Високомобільна група | |
---|
| (4.9) Grainyhead | |
---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
---|
| (4.11) Runt | |
---|
|
| | (0) Інші фактори транскрипції |
---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
---|
| (0.3) Pocket домен | |
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
| (0.6) Інші | |
---|
|
|
|