USP9X

USP9X
Ідентифікатори
Символи USP9X, DFFRX, FAF, FAM, MRX99, MRXS99F, ubiquitin specific peptidase 9, X-linked, ubiquitin specific peptidase 9 X-linked, XLID99
Зовнішні ІД OMIM: 300072 MGI: 894681 HomoloGene: 3418 GeneCards: USP9X
Пов'язані генетичні захворювання
non-syndromic X-linked intellectual disability[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

• cysteine-type peptidase activity
• co-SMAD binding
• GO:0070122 peptidase activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• cysteine-type endopeptidase activity
• hydrolase activity
• thiol-dependent deubiquitinase
• GO:1904265 deubiquitinase activity
• Lys48-specific deubiquitinase activity

Клітинна компонента

• цитоплазма
• гіалоплазма
• cell projection
• мембрана
• growth cone

Біологічний процес

• female gamete generation
• ubiquitin-dependent protein catabolic process
• chromosome segregation
• neuron migration
• GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• BMP signaling pathway
• протеоліз
• поділ клітини
• axon extension
• клітинний цикл
• transforming growth factor beta receptor signaling pathway
• Убіквітин-залежний протеоліз
• protein deubiquitination
• protein targeting to peroxisome
• regulation of circadian rhythm
• ритмічний процес
• protein stabilization
• protein K48-linked deubiquitination
• protein deubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process
• positive regulation of DNA demethylation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8239
22284
Ensembl
ENSG00000124486
ENSMUSG00000031010
UniProt
Q93008
P70398
RefSeq (мРНК)
NM_001039590
NM_001039591
NM_004652
NM_021906
NM_009481
RefSeq (білок)
NP_001034679
NP_001034680
NP_033507
Локус (UCSC) Хр. X: 41.09 – 41.24 Mb Хр. X: 12.94 – 13.04 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

USP9X (англ. Ubiquitin specific peptidase 9, X-linked) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 570 амінокислот, а молекулярна маса — 292 280[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MTATTRGSPVGGNDNQGQAPDGQSQPPLQQNQTSSPDSSNENSPATPPDE
QGQGDAPPQLEDEEPAFPHTDLAKLDDMINRPRWVVPVLPKGELEVLLEA
AIDLSKKGLDVKSEACQRFFRDGLTISFTKILTDEAVSGWKFEIHRCIIN
NTHRLVELCVAKLSQDWFPLLELLAMALNPHCKFHIYNGTRPCESVSSSV
QLPEDELFARSPDPRSPKGWLVDLLNKFGTLNGFQILHDRFINGSALNVQ
IIAALIKPFGQCYEFLTLHTVKKYFLPIIEMVPQFLENLTDEELKKEAKN
EAKNDALSMIIKSLKNLASRVPGQEETVKNLEIFRLKMILRLLQISSFNG
KMNALNEVNKVISSVSYYTHRHGNPEEEEWLTAERMAEWIQQNNILSIVL
RDSLHQPQYVEKLEKILRFVIKEKALTLQDLDNIWAAQAGKHEAIVKNVH
DLLAKLAWDFSPEQLDHLFDCFKASWTNASKKQREKLLELIRRLAEDDKD
GVMAHKVLNLLWNLAHSDDVPVDIMDLALSAHIKILDYSCSQDRDTQKIQ
WIDRFIEELRTNDKWVIPALKQIREICSLFGEAPQNLSQTQRSPHVFYRH
DLINQLQHNHALVTLVAENLATYMESMRLYARDHEDYDPQTVRLGSRYSH
VQEVQERLNFLRFLLKDGQLWLCAPQAKQIWKCLAENAVYLCDREACFKW
YSKLMGDEPDLDPDINKDFFESNVLQLDPSLLTENGMKCFERFFKAVNCR
EGKLVAKRRAYMMDDLELIGLDYLWRVVIQSNDDIASRAIDLLKEIYTNL
GPRLQVNQVVIHEDFIQSCFDRLKASYDTLCVLDGDKDSVNCARQEAVRM
VRVLTVLREYINECDSDYHEERTILPMSRAFRGKHLSFVVRFPNQGRQVD
DLEVWSHTNDTIGSVRRCILNRIKANVAHTKIELFVGGELIDPADDRKLI
GQLNLKDKSLITAKLTQISSNMPSSPDSSSDSSTGSPGNHGNHYSDGPNP
EVESCLPGVIMSLHPRYISFLWQVADLGSSLNMPPLRDGARVLMKLMPPD
STTIEKLRAICLDHAKLGESSLSPSLDSLFFGPSASQVLYLTEVVYALLM
PAGAPLADDSSDFQFHFLKSGGLPLVLSMLTRNNFLPNADMETRRGAYLN
ALKIAKLLLTAIGYGHVRAVAEACQPGVEGVNPMTQINQVTHDQAVVLQS
ALQSIPNPSSECMLRNVSVRLAQQISDEASRYMPDICVIRAIQKIIWASG
CGSLQLVFSPNEEITKIYEKTNAGNEPDLEDEQVCCEALEVMTLCFALIP
TALDALSKEKAWQTFIIDLLLHCHSKTVRQVAQEQFFLMCTRCCMGHRPL
LFFITLLFTVLGSTARERAKHSGDYFTLLRHLLNYAYNSNINVPNAEVLL
NNEIDWLKRIRDDVKRTGETGIEETILEGHLGVTKELLAFQTSEKKFHIG
CEKGGANLIKELIDDFIFPASNVYLQYMRNGELPAEQAIPVCGSPPTINA
GFELLVALAVGCVRNLKQIVDSLTEMYYIGTAITTCEALTEWEYLPPVGP
RPPKGFVGLKNAGATCYMNSVIQQLYMIPSIRNGILAIEGTGSDVDDDMS
GDEKQDNESNVDPRDDVFGYPQQFEDKPALSKTEDRKEYNIGVLRHLQVI
FGHLAASRLQYYVPRGFWKQFRLWGEPVNLREQHDALEFFNSLVDSLDEA
LKALGHPAMLSKVLGGSFADQKICQGCPHRYECEESFTTLNVDIRNHQNL
LDSLEQYVKGDLLEGANAYHCEKCNKKVDTVKRLLIKKLPPVLAIQLKRF
DYDWERECAIKFNDYFEFPRELDMEPYTVAGVAKLEGDNVNPESQLIQQS
EQSESETAGSTKYRLVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQRNGGDGERNRWYKF
DDGDVTECKMDDDEEMKNQCFGGEYMGEVFDHMMKRMSYRRQKRWWNAYI
LFYERMDTIDQDDELIRYISELAITTRPHQIIMPSAIERSVRKQNVQFMH
NRMQYSMEYFQFMKKLLTCNGVYLNPPPGQDHLLPEAEEITMISIQLAAR
FLFTTGFHTKKVVRGSASDWYDALCILLRHSKNVRFWFAHNVLFNVSNRF
SEYLLECPSAEVRGAFAKLIVFIAHFSLQDGPCPSPFASPGPSSQAYDNL
SLSDHLLRAVLNLLRREVSEHGRHLQQYFNLFVMYANLGVAEKTQLLKLS
VPATFMLVSLDEGPGPPIKYQYAELGKLYSVVSQLIRCCNVSSRMQSSIN
GNPPLPNPFGDPNLSQPIMPIQQNVADILFVRTSYVKKIIEDCSNSEETV
KLLRFCCWENPQFSSTVLSELLWQVAYSYTYELRPYLDLLLQILLIEDSW
QTHRIHNALKGIPDDRDGLFDTIQRSKNHYQKRAYQCIKCMVALFSNCPV
AYQILQGNGDLKRKWTWAVEWLGDELERRPYTGNPQYTYNNWSPPVQSNE
TSNGYFLERSHSARMTLAKACELCPEEVKKATSVQQIEMEESKEPDDQDA
PDEHESPPPEDAPLYPHSPGSQYQQNNHVHGQPYTGPAAHHMNNPQRTGQ
RAQENYEGSEEVSPPQTKDQ

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, убіквітинування білків, розходження хромосом, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, клітинних відростках.

Література

  • Vong Q.P., Cao K., Li H.Y., Iglesias P.A., Zheng Y. (2005). Chromosome alignment and segregation regulated by ubiquitination of survivin. Science. 310: 1499—1504. PMID 16322459 DOI:10.1126/science.1120160
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з USP9X переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Human PubMed Reference:.
  3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12632 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.
  5. ↑ UniProt, Q93008 (англ.) . Архів оригіналу за 9 квітня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

Див. також

Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії.
Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій.