TRIM29

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2CSV

Ідентифікатори

Символи

TRIM29, ATDC, tripartite motif containing 29

Зовнішні ІД

OMIM: 610658 MGI: 1919419 HomoloGene: 8100 GeneCards: TRIM29

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • p53 binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • cadherin binding involved in cell-cell adhesion • identical protein binding
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинний • цитоплазма • лізосома
Біологічний процес	• negative regulation of protein localization to nucleus • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • cell-cell adhesion • процес імунної системи • вроджений імунітет
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


23650


72169

Ensembl


ENSG00000137699


ENSMUSG00000032013

UniProt


Q14134


Q8R2Q0

RefSeq (мРНК)


NM_012101 NM_058193 NM_001330382


NM_023655

RefSeq (білок)


NP_001317311 NP_036233


NP_076144

Локус (UCSC)

Хр. 11: 120.11 – 120.19 Mb

Хр. 9: 43.22 – 43.25 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIM29 (англ. Tripartite motif containing 29) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 588 амінокислот, а молекулярна маса — 65 835^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAADASRSN	GSSPEARDAR	SPSGPSGSLE	NGTKADGKDA	KTTNGHGGEA
AEGKSLGSAL	KPGEGRSALF	AGNEWRRPII	QFVESGDDKN	SNYFSMDSME
GKRSPYAGLQ	LGAAKKPPVT	FAEKGELRKS	IFSESRKPTV	SIMEPGETRR
NSYPRADTGL	FSRSKSGSEE	VLCDSCIGNK	QKAVKSCLVC	QASFCELHLK
PHLEGAAFRD	HQLLEPIRDF	EARKCPVHGK	TMELFCQTDQ	TCICYLCMFQ
EHKNHSTVTV	EEAKAEKETE	LSLQKEQLQL	KIIEIEDEAE	KWQKEKDRIK
SFTTNEKAIL	EQNFRDLVRD	LEKQKEEVRA	ALEQREQDAV	DQVKVIMDAL
DERAKVLHED	KQTREQLHSI	SDSVLFLQEF	GALMSNYSLP	PPLPTYHVLL
EGEGLGQSLG	NFKDDLLNVC	MRHVEKMCKA	DLSRNFIERN	HMENGGDHRY
VNNYTNSFGG	EWSAPDTMKR	YSMYLTPKGG	VRTSYQPSSP	GRFTKETTQK
NFNNLYGTKG	NYTSRVWEYS	SSIQNSDNDL	PVVQGSSSFS	LKGYPSLMRS
QSPKAQPQTW	KSGKQTMLSH	YRPFYVNKGN	GIGSNEAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Leonhardt E.A., Kapp L.N., Young B.R., Murnane J.P. (1994). Nucleotide sequence analysis of a candidate gene for ataxia-telangiectasia group D (ATDC). Genomics. 19: 130—136. PMID 8188213 DOI:10.1006/geno.1994.1022
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Laderoute K.R., Knapp A.M., Green C.J., Sutherland R.M., Kapp L.N. (1996). Expression of the ATDC (ataxia telangiectasia group D-complementing) gene in A431 human squamous carcinoma cells. Int. J. Cancer. 66: 772—778. PMID 8647648 DOI:10.1002/(SICI)1097-0215(19960611)66:6<772::AID-IJC11>3.0.CO;2-5
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17274 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q14134 (англ.) . Архів оригіналу за 11 лютого 2018. Процитовано 8 вересня 2017.