MB21D1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4LEW, 4KM5, 4O67, 4MKP, 4LEV, 4O68, 4O69

Ідентифікатори

Символи

CGAS, C6orf150, cGAS, h-cGAS, Mab-21 domain containing 1, MB21D1, cyclic GMP-AMP synthase, Cyclic GMP-AMP synthase

Зовнішні ІД

OMIM: 613973 MGI: 2442261 HomoloGene: 51384 GeneCards: CGAS

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotidyltransferase activity • nucleotide binding • зв'язування з іоном металу • GTP binding • transferase activity • ATP binding • DNA binding • 2',3'-cyclic GMP-AMP synthase activity • double-stranded DNA binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• процес імунної системи • cyclic nucleotide biosynthetic process • cellular response to exogenous dsRNA • вроджений імунітет • activation of innate immune response • defense response to virus • positive regulation of defense response to virus by host • cellular response to DNA damage stimulus • positive regulation of type I interferon production • paracrine signaling • positive regulation of cellular senescence • positive regulation of cGMP-mediated signaling • positive regulation of cAMP-mediated signaling • regulation of immunoglobulin production • determination of adult lifespan • regulation of type I interferon production • regulation of immune response • regulation of T cell activation
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


115004


214763

Ensembl


ENSG00000164430


ENSMUSG00000032344

UniProt


Q8N884


Q8C6L5

RefSeq (мРНК)


NM_138441


NM_173386

RefSeq (білок)


NP_612450


NP_775562

Локус (UCSC)

Хр. 6: 73.41 – 73.45 Mb

Хр. 9: 78.34 – 78.35 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MB21D1 (англ. Mab-21 domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 522 амінокислот, а молекулярна маса — 58 814^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQPWHGKAMQ	RASEAGATAP	KASARNARGA	PMDPTESPAA	PEAALPKAGK
FGPARKSGSR	QKKSAPDTQE	RPPVRATGAR	AKKAPQRAQD	TQPSDATSAP
GAEGLEPPAA	REPALSRAGS	CRQRGARCST	KPRPPPGPWD	VPSPGLPVSA
PILVRRDAAP	GASKLRAVLE	KLKLSRDDIS	TAAGMVKGVV	DHLLLRLKCD
SAFRGVGLLN	TGSYYEHVKI	SAPNEFDVMF	KLEVPRIQLE	EYSNTRAYYF
VKFKRNPKEN	PLSQFLEGEI	LSASKMLSKF	RKIIKEEIND	IKDTDVIMKR
KRGGSPAVTL	LISEKISVDI	TLALESKSSW	PASTQEGLRI	QNWLSAKVRK
QLRLKPFYLV	PKHAKEGNGF	QEETWRLSFS	HIEKEILNNH	GKSKTCCENK
EEKCCRKDCL	KLMKYLLEQL	KERFKDKKHL	DKFSSYHVKT	AFFHVCTQNP
QDSQWDRKDL	GLCFDNCVTY	FLQCLRTEKL	ENYFIPEFNL	FSSNLIDKRS
KEFLTKQIEY	ERNNEFPVFD	EF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, противірусний захист, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ГТФ, ДНК, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Sun L., Wu J., Du F., Chen X., Chen Z.J. (2013). Cyclic GMP-AMP synthase is a cytosolic DNA sensor that activates the type I interferon pathway. Science. 339: 786—791. PMID 23258413 DOI:10.1126/science.1232458
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lee A., Park E.B., Lee J., Choi B.S., Kang S.J. (2017). The N terminus of cGAS de-oligomerizes the cGAS:DNA complex and lifts the DNA size restriction of core-cGAS activity. FEBS Lett. 591: 954—961. PMID 28214358 DOI:10.1002/1873-3468.12598
Kranzusch P.J., Lee A.S., Berger J.M., Doudna J.A. (2013). Structure of human cGAS reveals a conserved family of second-messenger enzymes in innate immunity. Cell Rep. 3: 1362—1368. PMID 23707061 DOI:10.1016/j.celrep.2013.05.008

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21367 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8N884 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.