CLIP2 : Література, Примітки, Див. також Вікіпедія

CLIP2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2CP2, 2CP3

Ідентифікатори

Символи

CLIP2, CLIP, CLIP-115, CYLN2, WBSCR3, WBSCR4, WSCR3, WSCR4, CAP-Gly domain containing linker protein 2

Зовнішні ІД

OMIM: 603432 MGI: 1313136 HomoloGene: 20718 GeneCards: CLIP2

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7461


269713

Ensembl


ENSG00000106665


ENSMUSG00000063146

UniProt


Q9UDT6


Q9Z0H8

RefSeq (мРНК)


NM_032421 NM_003388


NM_001039162 NM_009990

RefSeq (білок)


NP_003379 NP_115797


NP_001034251 NP_034120

Локус (UCSC)

Хр. 7: 74.29 – 74.41 Mb

Хр. 5: 134.52 – 134.58 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLIP2 (англ. CAP-Gly domain containing linker protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 046 амінокислот, а молекулярна маса — 115 837^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQKPSGLKPP	GRGGKHSSPM	GRTSTGSASS	SAAVAASSKE	GSPLHKQSSG
PSSSPAAAAA	PEKPGPKAAE	VGDDFLGDFV	VGERVWVNGV	KPGVVQYLGE
TQFAPGQWAG	VVLDDPVGKN	DGAVGGVRYF	ECPALQGIFT	RPSKLTRQPT
AEGSGSDAHS	VESLTAQNLS	LHSGTATPPL	TSRVIPLRES	VLNSSVKTGN
ESGSNLSDSG	SVKRGEKDLR	LGDRVLVGGT	KTGVVRYVGE	TDFAKGEWCG
VELDEPLGKN	DGAVAGTRYF	QCPPKFGLFA	PIHKVIRIGF	PSTSPAKAKK
TKRMAMGVSA	LTHSPSSSSI	SSVSSVASSV	GGRPSRSGLL	TETSSRYARK
ISGTTALQEA	LKEKQQHIEQ	LLAERDLERA	EVAKATSHIC	EVEKEIALLK
AQHEQYVAEA	EEKLQRARLL	VESVRKEKVD	LSNQLEEERR	KVEDLQFRVE
EESITKGDLE	TQTQLEHARI	GELEQSLLLE	KAQAERLLRE	LADNRLTTVA
EKSRVLQLEE	ELTLRRGEIE	ELQQCLLHSG	PPPPDHPDAA	EILRLRERLL
SASKEHQRES	GVLRDKYEKA	LKAYQAEVDK	LRAANEKYAQ	EVAGLKDKVQ
QATSENMGLM	DNWKSKLDSL	ASDHQKSLED	LKATLNSGPG	AQQKEIGELK
AVMEGIKMEH	QLELGNLQAK	HDLETAMHVK	EKEALREKLQ	EAQEELAGLQ
RHWRAQLEVQ	ASQHRLELQE	AQDQRRDAEL	RVHELEKLDV	EYRGQAQAIE
FLKEQISLAE	KKMLDYERLQ	RAEAQGKQEV	ESLREKLLVA	ENRLQAVEAL
CSSQHTHMIE	SNDISEETIR	TKETVEGLQD	KLNKRDKEVT	ALTSQTEMLR
AQVSALESKC	KSGEKKVDAL	LKEKRRLEAE	LETVSRKTHD	ASGQLVLISQ
ELLRKERSLN	ELRVLLLEAN	RHSPGPERDL	SREVHKAEWR	IKEQKLKDDI
RGLREKLTGL	DKEKSLSDQR	RYSLIDRSSA	PELLRLQHQL	MSTEDALRDA
LDQAQQVEKL	MEAMRSCPDK	AQTIGNSGSA	NGIHQQDKAQ	KQEDKH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Vandeweyer G., Van der Aa N., Reyniers E., Kooy R.F. (2012). The contribution of CLIP2 haploinsufficiency to the clinical manifestations of the Williams-Beuren syndrome. Am. J. Hum. Genet. 90: 1071—1078. PMID 22608712 DOI:10.1016/j.ajhg.2012.04.020

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2586 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UDT6 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.